1、熏蒸法 。利用臭氧的殺菌效果來達到清潔飲水機的目的 。把臭氧灌入飲水機的入水口，熏蒸半小時左右就可以消滅大部分有害細菌，消毒效果很好 ， 而且費用較低，缺點就是清理不了水垢，灰塵等雜質 ， 并且在熏蒸過程中，散發的臭氧對人體也有影響 。
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2、浸泡法 。把含氯的泡騰片泡水里之后，然后倒入飲水機的加熱內膽中，浸泡半小時左右 。最后用流水反復沖洗內膽，直到內膽干凈為止 。這種辦法的優點就是可以徹底清理水垢和雜質，還能有效清除大腸桿菌，白色念珠菌，枯黃桿菌黑色變種芽孢 。缺點就是含氯的泡騰片有很大的刺激性氣味，而且機內附作物吸收后就很難沖干凈，破壞水的口感，而且會腐蝕機器零部件，影響飲水機使用壽命 。因為價格低廉 ， 操作簡便，所以用含氯泡騰片消毒也是最為普及的 。
