數控加工中心坐標系包括機床坐標系和工件坐標系，不同的加工中心坐標系略有不同 。
一、機床坐標系
（1）Z坐標，平行于主軸，刀具離開工件的方向為正 。
（2）X坐標，與Z坐標垂直 ， 且刀具旋轉，以面對刀具主軸向立柱方向看，向右為正 。
（3）Y坐標，在Z, X坐標確定后，Y坐標用右手直角坐標系來確定 。
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機床坐標系原點也稱機械原點、參考點、零點，它是機床調試和加工時十分重要的基準點，通常開機后或自動換刀時都要使用機床回零 。所謂回零就是使運動部件回到機械原點，機械原點一般設在刀具或工作臺的最大行程處 ， 并且在機床標準坐標系的正方向 。有的加工中心換刀位置與機械原點不重合，則機械原點稱為第一參考點，換刀位置稱為第二參考點 。要注意的是 ， 機床裝配完畢后，第二參考點經調試確定，再不能變動 。
二、工件坐標系
工件坐標系是編程人員在編寫程序時 ， 在工件上建立的坐標系 。工件坐標系的原點方位為工件原點，也稱編程原點 。理論上，工件原點的設置是隨意的，但實際上 ， 它是編程人員依據零件特色為了編程方便以及尺寸的直觀性而設定的 。對加工中心來說，在準確挑選工件原點后，才能建立工件坐標系 。
工件原點的選用準則:
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（1）應使工件原點與零件的設計基準相重合 。
（2）應使編制數控程序時的運算最為簡單，避免出現尺寸鏈的計算誤差 。
（3）引起的加工誤差最小 。
（4）工件原點應選在容易找正且在加工過程中便于測量的位置 。
工件原點的位置 ， 對零件進行數學處理時就已經規定好了 ， 零件在機床上裝夾好后，這一點也就確定，但它是隨工件裝夾位置的不同而改變的 。所以，工件坐標系在機床上根據需要是可以變動的 。
